Curriculum Vitae

 

 

• 2014                 Habilitation à diriger des Recherches, section CNU 27, Université de Nantes
                           Approches par optimisation combinatoire et par apprentissage statistique en bioinformatique.
                           Applications pour la fouille et la modélisation de données complexes en génomique et en génétique.
                           soutenue le 28 mai 2014
                           Jury :  Jean-Daniel Zucker      Rapporteur, DR IRD, Bondy
                                     Christel Vrain                 Rapporteur, PU, Université d'Orléans
                                     Alain Viari                       Rapporteur, DR INRIA, Grenoble
                                     Thomas Schiex              Président du jury, DR INRA, Toulouse
                                     Christine Froidevaux    Examinateur, PU, Université d'Orsay
                                     Marc Gelgon                  Examinateur, PU, Université de Nantes
                                     Jin-Kao Hao                    Examinateur, PU, Université d'Angers
                                     Bernard Offmann         Examinateur, PU, Université de Nantes
                                     Louis Wehenkel             Examinateur, Full Professor, Université de Liège,  Belgique

                                               
                                        Philippe Leray                 Membre invité, PU, Université de Nantes
                                     Philippe Besnard            Membre Invité, DR, IRIT Toulouse / INRIA Rennes

   

• 2012 -             Co-responsable (M1 & M2) du Master de Bioinformatique de l'Université de Nantes
                          (M1 Bioinformatique / Biostatistique & M2 Bioinformatique)
   

• 2005 - 2012    Responsable du Master de Bioinformatique de l'Université de Nantes
                           (M1 Informatique pour la Biologie & M2 Bioinformatique)
   

• 2008 -             Membre de l'équipe DUKe, LINA      
   

• 2002 - 2008    Maître de Conférences, Université de Nantes, Faculté des Sciences et Techniques, Département Informatique,
                           Laboratoire d'Informatique de Nantes-Atlantique (LINA) - UMR CNRS 6241
                           Membre de l'équipe Combi
   

• 2000 - 2002    Maître de Conférences, Université de Clermont-Ferrand 2, Faculté des Sciences,
                           Département de Biologie, Unité associée Université Clermont-Ferrand 2 - INRA (OVGV,
                           Organisation et Variabilité des Génomes Végétaux)
   

• 1998 - 2000   Ingénieur, Ministère de l'Agriculture, Montpellier
                          (Traitements informatiques dans le secteur de l'agro-alimentaire)
                          Recherche en bioinformatique en "free-lance" (non rattachée à un laboratoire d'accueil)
   

• 1995-1998     Thèse de troisième cycle en Informatique, Université de Rennes 1
                          Grammaires à transformations morphiques, recherche de motif - exacte et approchée - adaptée aux séquences
                          génétiques : le système GTM
                          soutenue le 10 juillet 1998, mention Très Honorable
                          Jury : Alain Hénaut             Rapporteur, PU, Université de Versailles-Saint-Quentinen Yvelines
                                    Torsten Shaub           Rapporteur, Professeur, Université de Potsdam, Allemagne
                                    Philippe Besnard      Directeur de thèse, DR, IRISA / INRIA, Université de Rennes 1
                                    Jean-Pierre Banâtre  Président du Jury, PU, IRISA / INRIA,  Université de Rennes 1
                                    Olivier Ridoux            Examinateur, CR INRIA, IRISA / INRIA, Université de Rennes 1
                                    François Rodolphe    Examinateur, DR INRA, Jouy-en-Josas
   

• 1994-1995   D.E.A. en Informatique, IRISA / INRIA, Université de Rennes 1 (étudiante salariée à mi-temps)
                        Etude des liens entre les langages réactifs asynchrone et synchrone : application à Electre et Signal,  
                        co-encadrants Eric Rutten, CR IRISA / INRIAL Rennes, Université de Rennes 1 et Olivier Roux, MC, Université
                        de Nantes
   

• 1992-1994   Maîtrise d'Informatique, Université de Nantes (à titre d'étudiante salariée à mi-temps, deux années civiles
                        pour une année universitaire), Major de promotion
   

• 1990-1992   Reprise d'études, Licence d'Informatique, Université de Nantes (à titre d'étudiante salariée à mi-temps, deux
                        années civiles pour une année universitaire), Major de promotion
   

• 1987 - 1995  Ingénieur, Ministère de l'Agriculture, Direction Régionale de l'Agriculture, puis Direction Régionale de
                         l'Environnement, Pays de la Loire, Nantes, Service de l'Eau et des Milieux Aquatiques,
                         responsable de la division Qualité des Eaux et des laboratoires d'analyses physico-chimiques et hydrobiologiques
                         (5 personnes)
   

• 1985-87       Thèse de Docteur-Ingénieur en Mécanique des Fluides, Sciences et Techniques de l'Eau, Université Louis Pasteur,
                        Strasbourg 1
                        soutenue le 17 septembre 1987, mention Très Honorable
                        Ingénieur, Ministère de l'Agriculture, ENGEES, Strasbourg
                        (Enseignement en Informatique)
   

• 1984 - 85      D.E.A. en Mécanique des Fluides,  Sciences et Techniques de l'Eau, Institut de Mécanique des Flluides,
                        Université Louis Pasteur, Strasbourg 1
   

• 1982 - 1985   Diplôme d'Ingénieur de l'Ecole Nationale du génie de l'Eau et de l'Environnement (ENGEES), Strasbourg